GKJ Purworejo adalah salah satu Gereja Kristen Jawa di wilayah Klasis Purworejo. Didewasakan pada tanggal 4 Februari 1900, GKJ Purworejo adalah salah satu GKJ tertua di Sinode Gereja-gereja Kristen jawa. GKJ Purworejo juga salah satu gereja terbesar di Purworejo dengan jumlah jemaat 1032 orang. GKJ Purworejo memiliki dua pepanthan yaitu Pepanthan Kenteng dan Pepanthan Seren. Kiprah GKJ Purworejo sudah meluas, bahkan hingga ke luar pulau Jawa. Pada tahun 1938 GKJ Purworejo mengirim utusan untuk melakukan pembinaan iman bagi para transmigran di tanah Sumatera bagian selatan. Jemaat rintisan itu kini menjadi Sinode GKSBS (Gereja Kristen Sumatera Bagian Selatan). Kini GKJ Purworejo sedang melakukan renovasi gedung gereja yang ditargetkan selesai pada tahun 2023.